Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms