Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms