Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms