Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms