Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx3P81067 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx3P81067 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx3P81067 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx3P81067 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx3P81067 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx3P81067 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx3P81067 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms