Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf3P70671 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf3P70671 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf3P70671 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf3P70671 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf3P70671 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf3P70671 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf3P70671 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf3P70671 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf3P70671 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Irf3P70671 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Irf3P70671 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Irf3P70671 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf3P70671 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf3P70671 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf3P70671 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf3P70671 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf3P70671 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf3P70671 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf3P70671 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf3P70671 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf3P70671 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf3P70671 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf3P70671 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf3P70671 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms