Protein–RNA interactions for Protein: P70428

Ext2, Exostosin-2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ext2P70428 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ext2P70428 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ext2P70428 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ext2P70428 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ext2P70428 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ext2P70428 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ext2P70428 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ext2P70428 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ext2P70428 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ext2P70428 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ext2P70428 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms