Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx3P70354 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Msx3P70354 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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