Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad1P70340 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad1P70340 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad1P70340 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad1P70340 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms