Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms