Protein–RNA interactions for Protein: P61967

Ap1s1, AP-1 complex subunit sigma-1A, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s1P61967 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap1s1P61967 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap1s1P61967 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap1s1P61967 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap1s1P61967 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap1s1P61967 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap1s1P61967 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms