Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms