Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms