Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P58686 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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