Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd4P58467 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd4P58467 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd4P58467 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Setd4P58467 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms