Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms