Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cldn18P56857 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cldn18P56857 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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