Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1P56716 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1P56716 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1P56716 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1P56716 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1P56716 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1P56716 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms