Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms