Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NrlP54846 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NrlP54846 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrlP54846 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrlP54846 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrlP54846 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrlP54846 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrlP54846 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrlP54846 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrlP54846 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrlP54846 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrlP54846 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrlP54846 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrlP54846 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrlP54846 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrlP54846 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NrlP54846 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrlP54846 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrlP54846 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrlP54846 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrlP54846 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrlP54846 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrlP54846 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NrlP54846 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NrlP54846 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NrlP54846 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NrlP54846 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NrlP54846 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NrlP54846 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NrlP54846 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NrlP54846 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NrlP54846 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NrlP54846 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NrlP54846 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NrlP54846 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NrlP54846 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NrlP54846 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NrlP54846 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NrlP54846 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NrlP54846 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NrlP54846 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NrlP54846 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NrlP54846 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NrlP54846 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NrlP54846 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NrlP54846 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NrlP54846 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NrlP54846 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NrlP54846 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NrlP54846 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NrlP54846 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NrlP54846 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NrlP54846 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NrlP54846 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NrlP54846 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NrlP54846 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NrlP54846 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NrlP54846 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NrlP54846 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NrlP54846 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NrlP54846 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NrlP54846 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NrlP54846 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NrlP54846 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NrlP54846 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NrlP54846 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NrlP54846 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NrlP54846 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NrlP54846 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NrlP54846 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms