Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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