Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms