Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prox1P48437 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prox1P48437 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prox1P48437 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prox1P48437 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prox1P48437 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prox1P48437 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prox1P48437 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prox1P48437 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prox1P48437 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prox1P48437 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prox1P48437 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prox1P48437 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prox1P48437 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prox1P48437 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prox1P48437 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prox1P48437 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prox1P48437 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prox1P48437 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prox1P48437 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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