Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms