Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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