Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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