Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlx1P43345 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms