Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msh2P43247 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh2P43247 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms