Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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