Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VhlP40338 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VhlP40338 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VhlP40338 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VhlP40338 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
VhlP40338 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VhlP40338 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VhlP40338 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VhlP40338 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VhlP40338 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
VhlP40338 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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VhlP40338 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VhlP40338 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VhlP40338 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
VhlP40338 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VhlP40338 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VhlP40338 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VhlP40338 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VhlP40338 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VhlP40338 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VhlP40338 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VhlP40338 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VhlP40338 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VhlP40338 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VhlP40338 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VhlP40338 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VhlP40338 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VhlP40338 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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VhlP40338 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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VhlP40338 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VhlP40338 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VhlP40338 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VhlP40338 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
VhlP40338 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VhlP40338 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VhlP40338 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VhlP40338 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VhlP40338 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
VhlP40338 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VhlP40338 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VhlP40338 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VhlP40338 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
VhlP40338 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
VhlP40338 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
VhlP40338 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VhlP40338 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VhlP40338 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms