Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms