Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab21P35282 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab21P35282 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab21P35282 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms