Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp4P35123 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp4P35123 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp4P35123 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms