Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch4P31695 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch4P31695 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Notch4P31695 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms