Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms