Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms