Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms