Protein–RNA interactions for Protein: P23881

Tcea3, Transcription elongation factor A protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea3P23881 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcea3P23881 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms