Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpraP18052 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpraP18052 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpraP18052 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpraP18052 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpraP18052 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpraP18052 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpraP18052 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms