Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnaP17918 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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