Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prf1P10820 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prf1P10820 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prf1P10820 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prf1P10820 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prf1P10820 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prf1P10820 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms