Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd4P10628 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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