Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms