Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Me1P06801 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Me1P06801 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Me1P06801 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Me1P06801 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Me1P06801 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Me1P06801 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Me1P06801 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Me1P06801 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Me1P06801 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Me1P06801 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Me1P06801 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Me1P06801 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Me1P06801 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Me1P06801 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Me1P06801 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Me1P06801 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Me1P06801 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Me1P06801 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Me1P06801 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Me1P06801 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Me1P06801 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Me1P06801 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Me1P06801 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Me1P06801 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Me1P06801 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Me1P06801 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Me1P06801 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Me1P06801 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Me1P06801 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Me1P06801 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Me1P06801 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Me1P06801 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Me1P06801 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Me1P06801 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Me1P06801 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Me1P06801 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Me1P06801 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Me1P06801 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Me1P06801 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Me1P06801 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Me1P06801 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Me1P06801 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Me1P06801 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Me1P06801 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Me1P06801 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Me1P06801 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Me1P06801 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Me1P06801 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Me1P06801 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Me1P06801 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Me1P06801 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Me1P06801 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Me1P06801 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Me1P06801 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Me1P06801 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Me1P06801 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Me1P06801 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Me1P06801 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Me1P06801 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Me1P06801 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Me1P06801 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Me1P06801 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Me1P06801 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Me1P06801 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Me1P06801 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Me1P06801 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Me1P06801 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Me1P06801 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms