Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprcP06800 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PtprcP06800 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PtprcP06800 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PtprcP06800 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PtprcP06800 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprcP06800 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprcP06800 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprcP06800 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprcP06800 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprcP06800 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprcP06800 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms