Protein–RNA interactions for Protein: P05531

Xlr, X-linked lymphocyte-regulated protein PM1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XlrP05531 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XlrP05531 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
XlrP05531 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XlrP05531 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XlrP05531 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
XlrP05531 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XlrP05531 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XlrP05531 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XlrP05531 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XlrP05531 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XlrP05531 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XlrP05531 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XlrP05531 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XlrP05531 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XlrP05531 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XlrP05531 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XlrP05531 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XlrP05531 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XlrP05531 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XlrP05531 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XlrP05531 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
XlrP05531 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XlrP05531 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XlrP05531 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XlrP05531 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XlrP05531 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XlrP05531 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XlrP05531 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XlrP05531 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XlrP05531 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XlrP05531 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XlrP05531 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XlrP05531 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XlrP05531 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XlrP05531 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XlrP05531 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XlrP05531 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XlrP05531 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XlrP05531 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XlrP05531 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XlrP05531 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XlrP05531 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
XlrP05531 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
XlrP05531 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
XlrP05531 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
XlrP05531 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
XlrP05531 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
XlrP05531 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
XlrP05531 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XlrP05531 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XlrP05531 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XlrP05531 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XlrP05531 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XlrP05531 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XlrP05531 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XlrP05531 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XlrP05531 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XlrP05531 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XlrP05531 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XlrP05531 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XlrP05531 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XlrP05531 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XlrP05531 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XlrP05531 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XlrP05531 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XlrP05531 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XlrP05531 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XlrP05531 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XlrP05531 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XlrP05531 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XlrP05531 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XlrP05531 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
XlrP05531 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XlrP05531 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms