Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
P01748 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P01748 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P01748 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P01748 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P01748 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P01748 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P01748 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P01748 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P01748 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P01748 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P01748 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P01748 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P01748 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P01748 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P01748 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P01748 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01748 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01748 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01748 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01748 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01748 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01748 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01748 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01748 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01748 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01748 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms