Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl2O89104 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms