Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klc1O88447 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klc1O88447 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klc1O88447 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klc1O88447 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klc1O88447 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klc1O88447 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klc1O88447 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms