Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtssO70370 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtssO70370 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtssO70370 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtssO70370 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtssO70370 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtssO70370 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtssO70370 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtssO70370 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtssO70370 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtssO70370 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtssO70370 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtssO70370 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtssO70370 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtssO70370 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtssO70370 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtssO70370 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtssO70370 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtssO70370 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtssO70370 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtssO70370 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtssO70370 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtssO70370 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CtssO70370 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtssO70370 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtssO70370 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtssO70370 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtssO70370 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtssO70370 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CtssO70370 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtssO70370 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtssO70370 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtssO70370 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms